La sede principale dell’istituto è situata in Via Celoria a Città Studi, all’interno del campus universitario dell’Università degli Studi di Milano, Dipartimento di Fisica.
La sezione è organizzata al suo interno con attrezzature e personale dedicati a sostenere l’attività di ricerca ed allo sviluppo di attrezzature tecnologicamente avanzate attraverso i servizi di elettronica, di officina meccanica e progettazione, di calcolo, oltre alla presenza del servizio di direzione ed all’amministrazione.
La sezione di Milano è coinvolta in varie attività nel settore della fisica delle particelle, delle astroparticelle, fisica nucleare, fisica teorica e sviluppo di nuove tecnologie.